Computational Intelligence for Computational Biology (IICT, Yverdon-les-bains)
Équipe dirigée par Carlos Andrés Peña (courriel), HEIG-VD, Yverdon-les-bains - Institute for Information and Communication Technologies / Swiss Institute of Bioinformatics SIB
site du laboratoire mais aussi ici et là
Composition de l'équipe : 3 personnes dont 1 permanent
Sujet principal : L’équipe CI4CB se concentre sur le développement de techniques d’intelligence artificielle et sur leur application face à des problèmes du monde réel, en particulier ceux liés aux sciences de la vie, au génie biomédical. Notre objectif est de découvrir des modèles cachés dans ces données, ainsi que de construire des modèles basés sur les données. Nos principaux projets dans le domaine de la phagothérapie : Développement de modèles in silico de réseaux d'infection phage-bactérie en utilisant leurs caractéristiques génomiques, avec des techniques d'apprentissage automatique (collab. G. Resch UNIL & Y. Que Inselspital) – Exploration des méthodes potentielles, basées sur la combinaison Réseaux Neuronaux Profonds (DNN) et des Réseaux Antagonistes Génératifs (GAN), pour générer des segments de génome de phage qui amélioreraient l'interaction avec une bactérie cible.
Mots-clés : Deep-learning, interaction phage-bactérie, génomique, modélisation prédictive, bioinformatique