Dynamiques des Communautés Phagiques (CNRS UMR8104, Paris)

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Composition de l'équipe : 8 personnes dont 6 permanents

Sujet principal : Le projet est développé au sein de l'équipe "Robustesse et Évolvabilité de la Vie" dirigée par Ivan Matic qui s'intéresse aux variations génétiques et phénotypiques qui émergent dans les populations bactériennes en réponse aux stress environnementaux. Dans la plupart des écosystèmes, les bactéries sont confrontées à diverses populations de phages et réciproquement, les phages sont souvent en compétition pour l’accès à un hôte. Cependant, nos connaissances des dynamiques phage-bactérie reposent majoritairement sur l’étude de modèles 1 phage-1 bactérie, qui ne capturent pas la complexité des interactions existant au sein de communautés multi-espèces. Mon projet de recherche s'intéresse aux dynamiques écologiques et évolutives de communautés composées du pathogène opportuniste Pseudomonas aeruginosa et de plusieurs espèces de phages qui lui sont spécifiques. En particulier, je cherche à comprendre comment varient les différentes populations au sein des communautés et comment ces variations dépendent de l’émergence de mécanismes de résistance bactériens et d’interactions phage-phage. J'étudie également comment les génomes phagiques et bactérien évoluent, sur le plus long terme, au sein de ces communautés. Ce programme de recherche permettra de mieux comprendre les interactions phage-bactérie dans les écosystèmes naturels et génèrera également des données utiles pour le développement de cocktails de phages thérapeutiques.

Mots-clés : Écologie des communautés, Interactions phage-phage, Sociovirologie, Systèmes de défense anti-phage, Évolution expérimentale, Coévolution, Microbiologie moléculaire

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