Dynamique des génomes de bactériophages (unité MICALIS, Jouy en Josas)
Marie-Agnès Petit (courriel), INRAE, Jouy en Josas, Micalis
Composition de l'équipe : 10 personnes dont 6 permanents
Sujet principal : Nos objectifs sont de comprendre le comportement des phages tempérés dans l'intestin en utilisant à la fois des approches globales et de reconstruction, de comprendre comment les phages évoluent et acquièrent de nouveaux gènes, et de développer de nouveaux outils bio-informatiques pour faciliter l'annotation du génome des phages. L'équipe étudie également les intéractions phage virulent-hôte, chez les Entérocoques.
Mots-clés : capture de gène, recombinaison, évolution, viromes, interactions phage-bactérie
Interactions
| Nom de l'espèce bactérienne cible | Nom du/des bactériophage(s) |
| Escherichia coli | Lambda, Evi, Fraca, Gally etc.. |
| Enterococcus faecium | Athos, Porthos, Aramis, Artagnan |
| Roseburia intestinalis | Shimadzu, Lagaffe |
| Intestin, aliments | viromes |